药学院校内药学实训中心总面积11400平方米,实验实训设施完备,拥有中央财政支持的高职教育生物制药实训基地、福建省科普教育基地药用植物园、药学科研中心、市级现代中药重点实验室、中药标本馆、药物制剂生产实训车间等,拥有电子扫描显微镜室、高效液相色谱仪、气质联用仪、快速制备液相色谱仪、原子吸收分光度计等药学类专业教学、科研仪器设备,已建成药物制剂生产实训室和药品储存养护实训室两个教育部“1+X”证书试点项目实训室以及中药炮制、药品检验、药理学、药学服务四个虚拟仿真实训平台,可满足各专业教学科研需要。
在全省各地市建立了稳定的校外实训实习基地82个,其中校企合作实习基地45个,校企联办省级聚善堂中药产业学院。